לאורך המסילה הוא סיפור נדודיו ומאבקיו של יענקלה בתקופת מלחמת העולם השנייה. משפחתו של יענקלה, כמשפחות רבות אחרות, ברחה מפולין לרוסיה מפחד ההשמדה. ברוסיה יש מחסור במזון, הגברים מגויסים לצבא, והנשים נשלחות לעבודת פרך. הגרמנים מפציצים את הרכבות בנסיעתן, רבים נפגעים, משפחות נפרדות וילדים נותרים לבדם.
יום אחד מוצא יענקלה את עצמו לבדו לאחר הפצצה. מעתה עליו להתמודד לבדו, לדאוג לעצמו למזון ומחסה. הוא מחפש את אמו ואחותו שאבדו תוך כדי מאבק בבדידות, בקור, ברעב ובפחד. הוא מתגנב לרכבות ומתחבא בערֵמות פחם.
בחיפושיו הוא עובר על פני אזורים נרחבים של ברית־המועצות. הוא מגיע לערים מוסלמיות ונוצריות, למקומות לוהטים בחומם ולמקומות קפואים בשלג. גם בשעות הקשות ביותר הוא אינו מאבד את התקווה.
זהו סיפור מרתק, לעתים עצוב ולעתים מצחיק, על מאבקו של ילד שהצליח לשרוד.